Алунит формируется в близповерхностных условиях, в результате низкотемпературного гидротермального процесса минералообразования в интервале температур 15—400 °С, при воздействии реакционных сульфатных вод, образованных в результате сольфатарной деятельности или при разложении пирита на глинозёмистые породы, процесс обычно сопровождается каолинизацией или окварцеванием.

Также известно экзогенное происхождение алунита: зоны окисления сульфидных месторождений